赣江中药创新中心为省属事业法人机构，主要承担本草物质科学研究设施的预研、建设、运行和管理，并开展相关领域的科学研究工作。
中心的目标是集聚多学科交叉和多层次融合的研究团队，构建本草物质科学研究综合性技术平台，成为突破中药基础科学问题与构建中药核心技术体系的策源地，建成世界上第一个传统药物和天然产物研究装置，努力把本草物质科学研究设施打造成中药研究的国之重器，解决中药物质组成结构、作用靶点、协同机理的科学问题，满足有效方剂的解析，中药新药创制和中药质量标准化等重大应用需求。